Яндекс Маркет по просьбам продавцов добавил сразу две вещи, которые должны свести работу с остатками к минимуму.
Автоматический учет резервов

Раньше в качестве остатка указывалось количество всех товаров, которые есть у продавца — свободных и зарезервированных под заказы. Теперь же появился автоматический учет резервов, позволяющий передавать в качестве остатка только доступные для продажи товары. Проще всего узнавать эту цифру с помощью отчета.